La utilización de abonos orgánicos en fertirrigación puede presentar importantes ventajas para el cultivo y su agrosistema, pero también puede generar una serie de inconvenientes sobre el sistema hidráulico y los componentes de riego. Por ejemplo, la presencia de microrganismos en los abonos y en el agua de riego, sumado a otros factores intrínsecos y extrínsecos de la finca, pueden generar la proliferación de biopelículas microbianas en tuberías y otros elementos que constituyen las instalaciones de riego. Este hecho produce la reducción progresiva del paso efectivo de disolución fertilizante dentro de las tuberías, elementos especiales y emisores, alterando los parámetros hidráulicos y disminuyendo la homogeneidad y producción del cultivo. En una finca localizada en la isla de Tenerife dedicada al cultivo de platanera con fertirrigación y utilización de goteros autocompensantes, se realizaron dos tratamientos con hipoclorito de sodio (NaClO) a 2 y 5 mg/L y se evaluaron los efectos microscópicos sobre los goteros mediante microscopía electrónica de barrido (SEM), técnicas de tratamiento de imagen así como la presencia de fases cristalinas diferenciadoras mediante difracción de rayos X antes y después de los tratamientos. Los resultados obtenidos mostraron la eficacia de los tratamientos reduciendo en torno a un 30% las zonas de depósitos de suciedad en todos los componentes de los emisores ensayados.