El cultivo en sustrato se inicia en 1986 en el SIMA de Derio. Debido a su importancia tecnicoeconómica, los ensayos de sustratos han sido una constante en las investigaciones realizadas en el SIMA de Derio en relación con los cultivos sin suelo. Por otro lado existe una fuerte inquietud hoy día en cuanto a la elección del sustrato en cultivo de pimiento de Gernika debido a la aparición de enfermedades que pueden condicionar la elección de uno u otro tipo de sustrato. Los sustratos que mayoritariamente se manejan entre nuestros horticultores son la lana de roca y la perlita. En este trabajo se realizó un ensayo con dos sustratos, Lana de roca Expert, de Grodan (LRe), y Perlita, de Agroperl (PAg). Paralelamente al ensayo se pusieron otros dos sustratos más en colección, que eran: Lana de roca Master, de Grodan (LRm) y Perlita de Iberperlita (PIb).

En ensayo no se han detectado diferencias significativas en el análisis estadístico. Se aprecia una ligera mayor precocidad en Lana de roca. Por otro lado, la perlita (PAg) aventaja, también ligeramente a la Lana de roca (LRe) en producción total. No se aprecian diferencias significativas en la calidad de los frutos. En colección destacó la Lana de roca Master, con una producción significativamente mayor que la Iberperlita e, incluso, que los dos sustratos del ensayo.